miRBase物种名缩写

研究miRNA的同学们应该都听说过或者用过miRbase这个数据库（http://www.mirbase.org/）。里面提供了285个物种中已知的所有miRNA信息。还不知道miRNA为何物的同学们，赶紧去恶补一下--》MicroRNA 的结构、生物合成及功能《--。

人这个物种大家研究的比较多，所以可能大家都知道人的miRNA都是以hsa开头的，如hsa-miR-25-3p。如果也做过小鼠，应该也知道小鼠的miRNA都是以mmu开头的，如mmu-mir-100。因此我们可以在miRbase的下载页面去下载相应物种的miRNA信息。

但是对于那些不常研究的物种，估计很少有人知道他们物种缩写是什么。那有没有这么一张表，能告诉我们所有物种的缩写呢？今天小编就来告诉大家怎么能弄到这样一张表。方法有两个

1. miRbase官网下载

打开是这样的，包括物种缩写，拉丁文全名，界门纲目科属种都能查到，最后还有物种id号。是不是so easy！

2. 对于会R的人，我们也提供R代码来获取这张表。

BiocManager::install("mirbase.db")
library(mirbase.db)
write.table(toTable(mirbaseSPECIES),file = "organism.txt",quote = F,sep = "t")

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