bigWigMerge合并bigwig文件
时间:2022-07-22
本文章向大家介绍bigWigMerge合并bigwig文件,主要内容包括其使用实例、应用技巧、基本知识点总结和需要注意事项,具有一定的参考价值,需要的朋友可以参考一下。
UCSC的软件中bigWigMerge和bedGraphToBigWig可以把多个bigwig文件合并。
bigWigMerge下载:
conda install -c bioconda ucsc-bigwigmerge
conda install -c bioconda/label/cf201901 ucsc-bigwigmerge
bigWigMerge说明:
也支持通配符,比如:
bigWigMerge heart_*.bw heart.bedGraph
运行后可生成合并后的bedGraph文件,然后可以通过UCSC中的bedGraphToBigWig再转回bigwig (其中bedGraph必须是sort过的,否则会报错):
sort -k1,1 -k2,2n heart.bedGraph > heart.sorted.bedGraph
bedGraphToBigWig heart.sorted.bedGraph ~/mm10/mm10.chrom.sizes heart_merged.bw
提供参考基因组的染色体大小文件即可转回来。
- python在租房过程中的应用
- python爬虫反爬取---设置IP代理自动变换requests.get()中proxy的IP
- 【译】TensorFlow实现Batch Normalization
- 关于Python语言规范你需要知道的一些小tips
- R语言可视化——REmap(路径图)
- python面向对象
- 字符串hash入门
- R语言数据处理——数据合并与追加
- python爬取链家租房之获取房屋页面的详细信息(房名,地址,房价,面积,url)
- 信用卡“坏账”客户分析(二)
- Mac上提升python运算速度-PyPy初体验
- python处理json数据(复杂的json转化成嵌套字典并处理)
- Pointer-network理论及tensorflow实战
- python3 log文件处理获取某天需要的数据
- JavaScript 教程
- JavaScript 编辑工具
- JavaScript 与HTML
- JavaScript 与Java
- JavaScript 数据结构
- JavaScript 基本数据类型
- JavaScript 特殊数据类型
- JavaScript 运算符
- JavaScript typeof 运算符
- JavaScript 表达式
- JavaScript 类型转换
- JavaScript 基本语法
- JavaScript 注释
- Javascript 基本处理流程
- Javascript 选择结构
- Javascript if 语句
- Javascript if 语句的嵌套
- Javascript switch 语句
- Javascript 循环结构
- Javascript 循环结构实例
- Javascript 跳转语句
- Javascript 控制语句总结
- Javascript 函数介绍
- Javascript 函数的定义
- Javascript 函数调用
- Javascript 几种特殊的函数
- JavaScript 内置函数简介
- Javascript eval() 函数
- Javascript isFinite() 函数
- Javascript isNaN() 函数
- parseInt() 与 parseFloat()
- escape() 与 unescape()
- Javascript 字符串介绍
- Javascript length属性
- javascript 字符串函数
- Javascript 日期对象简介
- Javascript 日期对象用途
- Date 对象属性和方法
- Javascript 数组是什么
- Javascript 创建数组
- Javascript 数组赋值与取值
- Javascript 数组属性和方法
- TS 设计模式01 - 工厂模式
- Spring与Mybatis的整合
- Python中的计数 - Counter类
- vue 记账本
- c/c++补完计划(三): 素数统计
- Python正则表达式(上)
- 附001.Nginx location语法规则
- 016.Nginx HTTPS
- 架构师写的BUG,非比寻常
- Python爬虫获取豆瓣TOP250电影详情
- docker容器常用命令
- MapReduce之自定义分区器Partitioner
- MySQL ORDER BY,GROUPBY 与各种JOIN
- (三) Mybatis动态SQL语句 - Titan的Mybatis系列学习笔记
- (二) 使用Mybatis完成CRUD操作 - Titan的Mybatis系列学习笔记