技能 | R语言的igraph画社交关系图示例

R语言中的igraph可以很方便地画出社交关系图。下面是几个示例。

1.最简单的社交关系图

library(igraph)
dolphin <- read.csv('dolphins.csv'，head=T，fileEncoding='UTF-8'，stringsAsFactors=F)
g <- graph.data.frame(dolphin)
jpeg(filename='dolphins.jpg'，width=800，height=800，units='px')
plot(g，
vertex.size=5，
layout=layout.fruchterman.reingold，
vertex.shape='circle'，
vertex.label.cex=1.0，
vertex.label.color='black'，
edge.arrow.size=0) #连线的箭头的大小为0，即无箭头
dev.off()

画出的图，如下：

2.关系图中某人或某几个人的关系图

某个人（这里是海豚）的关系图(节点4)：

jpeg(filename='dolphins_sub.jpg'，width=800，height=800，units='px')
gn<-graph.neighborhood(g， order=1)
plot(gn[[1]]，
layout=layout.fruchterman.reingold)
dev.off()

某个人的两层关系图(节点6)：

gn<-graph.neighborhood(g， order=2)
plot(gn[[2]]， layout=layout.fruchterman.reingold)
dev.off()

某两个人的关系图：

jpeg(filename='dolphins_sub3.jpg'，width=800，height=800，units='px')
gn<-graph.neighborhood(g， order=1)
plot(gn[[1]]+gn[[2]]， layout=layout.fruchterman.reingold)
dev.off()

3.根据联系人的多少决定节点的大小和色彩，连线设成弧线

source("http：//michael.hahsler.net/SMU/ScientificCompR/code/map.R")
E(g)$curved <- 0.2 #将连线设成弧线，数值越大弧线越弯
jpeg(filename='dolphins_curve1.jpg'，width=800，height=800，units='px')
layout=layout.fruchterman.reingold
plot(g， layout=layout， vertex.size=map(degree(g)，c(1，20))， vertex.color=map(degree(g)，c(1，20)))
dev.off()

4.给社交关系图划分社区，不同的社区用不同的颜色表示

cl <- optimal.community(g)
E(g)$curved <- 0
jpeg(filename='dolphins_commu2.jpg'，width=800，height=800，units='px')
layout=layout.fruchterman.reingold
plot(g， layout=layout， vertex.size=5， vertex.color= rainbow(10， .8， .8， alpha=.8)[cl$membership+1L]，)
dev.off()

5.设定社区的数目

sg1 <- cluster_spinglass(g， spins=3， gamma=1.0) #spins是社区的数目
jpeg(filename='dolphins_commu9.jpg'，width=800，height=800，units='px')
layout=layout.fruchterman.reingold
plot(g， layout=layout， vertex.size=5， vertex.color= rainbow(10， .8， .8， alpha=.8)[sg1$membership]，)
dev.off()

6.画出某一社区

画出示例5的社区中，membership为1的社区。

sg1 <- cluster_spinglass(g， spins=3， gamma=1.0)
jpeg(filename='dolphins_subcommu.jpg'，width=800，height=800，units='px')
layout=layout.fruchterman.reingold
subg <- induced.subgraph(g， which(membership(sg1)==1))
plot(subg， layout=layout， vertex.size=5， vertex.color= 1，)
dev.off()

7.不同布局方式下社区的显示

以上的布局为layout=layout.fruchterman.reingold

如果是其他布局，社区的显示会有变化。

sg1 <- cluster_spinglass(g， spins=3， gamma=1.0)
jpeg(filename='dolphins_commu10.jpg'，width=800，height=800，units='px')
layout=layout.circle
plot(g， layout=layout， vertex.size=5， vertex.color= rainbow(10， .8， .8， alpha=.8)[sg1$membership]，)
dev.off()

sg1 <- cluster_spinglass(g， spins=3， gamma=1.0)
jpeg(filename='dolphins_commu11.jpg'，width=800，height=800，units='px')
layout=layout.sphere
plot(g， layout=layout， vertex.size=5， vertex.color= rainbow(10， .8， .8， alpha=.8)[sg1$membership]，)
dev.off()

以上的示例仅为抛砖引玉。

有关igraph的demo可以看demo(package="igraph")。

在R中键入demo(package="igraph")，它会给出子项目：

centrality Classic and other vertex centrality indices
cohesive Cohesive blocking， the Moody & White method
community Community structure detection
crashR A crash-course into R
hrg Hierarchical random graphs
smallworld Small-world networks

然后键入子项目看demo。如demo(package="igraph"， community)，它会给出community的示例。