同样的GitHub包你就下载失败

对R语言熟练的小伙伴，通常是不仅仅使用CRAN或者bioconductor的包，也会尝试很多开发者未正式发表的包，比如存放在GitHub等仓库的。正常情况下，很容易下载和安装，我让学徒使用她的Windows电脑测试了，使用以下代码：

library(devtools)
install_github("jmzeng1314/AnnoProbe")
library(AnnoProbe)
gpl='GPL16956'
probe2gene=idmap(gpl,type = 'pipe')
head(probe2gene)

真的是如丝滑般顺利啊，首先，安装GitHub在线包，需要devtools包或者remotes里面的install_github函数：

加载devtools包或者remotes包

加载了devtools包或者remotes包后就可以使用install_github函数，如下：

使用install_github函数

可以看到，很简单就成功了，因为这个包本身就不大，下载速度也ok，包本身就两三个函数，并不复杂。

很容易安装成功

那么，为什么大家重复这个代码就会遇到各种各样的花式报错呢？

首先第一个原因就是网络问题，中国大陆部分地区访问GitHub非常困难，报错如下：

481595150473_.pic_hd

这个时候，可以试试看另外一个下载方式，install_git函数，代码如下：

library(remotes)
url='https://gitee.com/jmzeng/annoprobe.git'
install_git(url)

并不是说这个函数有多牛，而是因为我把这个annoprobe主动备份到了 gitee.com ，因为gitee.com的服务器在中国大陆，所以在中国大陆的朋友们访问它理论上是非常畅通的。

但并不是所有的的GitHub包都被备份到了gitee.com，所以你有两个策略，首先可以自己主动去gitee.com注册一个账号，然后把别人的GitHub包搬运到你的gitee.com账户，这样你就可以很方便安装了。另外一个办法就是采用特殊办法去先下载GitHub离线包并且解压，然后使用

install.packages("GitHub项目下载路径-master/",repos=NULL,type="source")

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