备忘：美化pymol作图1

时间:2022-07-26
本文章向大家介绍备忘：美化pymol作图1，主要内容包括其使用实例、应用技巧、基本知识点总结和需要注意事项，具有一定的参考价值，需要的朋友可以参考一下。
  • 读取pymol，显示sequence
  • 将24-26号氨基酸改为β折叠
alter 24-26/, ss='S'
rebuild

类似的代码还有如下，将不同的序列部分改为helix，loop，和sheet等

show cartoon
alter 11-40/, ss='H'             # assign residues 11-40 as helix
alter 40-52/, ss='L'             # assign residues 40-52 as loop
alter 52-65/, ss='S'             # assign residues 52-65 as sheet
alter 65-72/, ss='H'             # assign residues 65-72 as helix
rebuild                          # regenerate the cartoon

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