JBrowse安装配置的一些教程
时间:2022-07-22
本文章向大家介绍JBrowse安装配置的一些教程,主要内容包括其使用实例、应用技巧、基本知识点总结和需要注意事项,具有一定的参考价值,需要的朋友可以参考一下。
- 1 如果有一个云服务器你会做什么?
- 2 用JBrowse搭建基因组浏览器
- 3 Jbrowse 安装及使用说明
- 4 jbrowse centos安装过程
- 5 JBrowse使用说明:如何安装JBrowse
- 6 可能是最全的JBrowse基因浏览器介绍
我用的是Ubuntu系统
按照 JBrowse使用说明:如何安装JBrowse这篇教程中的步骤进行安装 用到的命令是
sudo mkdir /var/www/jbrowse
sudo chown `whoami` /var/www/jbrowse
cd /var/www/jbrowse
# unzip it and cd into it
unzip JBrowse-1.16.9.zip
cd JBrowse-1.16.9
# run setup.sh, quick start with example data
./setup.sh
这里需要注意的是sudo chown `whoami` /var/www/jbrowse
这行命令里 不是单引号,而是ESC键下面那个
./setup.sh
这一步会运行好长时间,因为需要安装好多依赖的perl模块,这里吐槽一下perl模块的安装好麻烦,或者是我自己没有掌握正确的安装方法吧!
我的nginx已经安装好了 在自己的电脑浏览器输入http://123.56.89.209/jbrowse/JBrowse-1.16.9/index.html?data=sample_data/json/volvox
报错
暂时还不知道是什么原因
然后我将 /var/www/html/
目录下的index.nginx-debian.html
文件删除掉了(记得备份),然后将 /var/www//jbrowse/JBrowse-1.16.9/
目录下的所有内容都复制到了/var/www/html/
目录下
cp -R ../jbrowse/JBrowse-1.16.9/* ./
然后在自己本地电脑浏览器输入http://123.56.89.209/index.html?data=sample_data/json/volvox
终于看到了结果
接下来需要学习的是
- 如何准备自己的数据?
- 有没有办法将结果整合到Django里?
- Javascript基础回顾 之(三) 面向对象
- Javascript基础回顾 之(二) 作用域
- 一不小心写了个WEB服务器
- 遍历算法(1)
- Membership三步曲之入门篇 - Membership基础示例
- Java-String.intern的深入研究
- 从Membership 到 .NET4.5 之 ASP.NET Identity
- Membership三步曲之进阶篇 - 深入剖析Provider Model
- java finally深入探究
- 背后的故事之 - 快乐的Lambda表达式(一)
- 背后的故事之 - 快乐的Lambda表达式(二)
- JVM GC杂谈之理论入门
- 线程池定制初探
- 由浅入深表达式树(二)遍历表达式树
- JavaScript 教程
- JavaScript 编辑工具
- JavaScript 与HTML
- JavaScript 与Java
- JavaScript 数据结构
- JavaScript 基本数据类型
- JavaScript 特殊数据类型
- JavaScript 运算符
- JavaScript typeof 运算符
- JavaScript 表达式
- JavaScript 类型转换
- JavaScript 基本语法
- JavaScript 注释
- Javascript 基本处理流程
- Javascript 选择结构
- Javascript if 语句
- Javascript if 语句的嵌套
- Javascript switch 语句
- Javascript 循环结构
- Javascript 循环结构实例
- Javascript 跳转语句
- Javascript 控制语句总结
- Javascript 函数介绍
- Javascript 函数的定义
- Javascript 函数调用
- Javascript 几种特殊的函数
- JavaScript 内置函数简介
- Javascript eval() 函数
- Javascript isFinite() 函数
- Javascript isNaN() 函数
- parseInt() 与 parseFloat()
- escape() 与 unescape()
- Javascript 字符串介绍
- Javascript length属性
- javascript 字符串函数
- Javascript 日期对象简介
- Javascript 日期对象用途
- Date 对象属性和方法
- Javascript 数组是什么
- Javascript 创建数组
- Javascript 数组赋值与取值
- Javascript 数组属性和方法