多系列数据核密度图
ggridges包提供了geom_density_ridges_gradient()函数,用于画核密度估计峰峦图
1数据结构
这里我们用到的是ggridges内了数据lincoln_weather,该数据是关于每个月各种天气指标,包括温度湿度等等,其中我们要用到的两列为平均温度mt和月份mon,这是我简化后的数据,便于展示
与单数据系列不同的是这里要提供两个变量,x轴对应温度,即统计变量,y轴为分类变量
2绘制峰峦图代码
library(ggplot2)
library(ggridges)
library(RColorBrewer)
ggplot(lincoln_weather, aes(x = `Mean Temperature [F]`, y = `Month`, fill = ..density..)) + # ..density.. 指按照计算出来的density填充颜色
#rel_min_height:relative to heightest point,指定去掉尾部的范围,一般0.01会比较好
# scale ;The extent to which the different densities overlap can be controlled with the parameter.该参数控制的是密度图之间重叠的程度,值越小越分开,越大月重叠
geom_density_ridges_gradient(scale =3, rel_min_height = 0.00,size = 0.3) +
scale_fill_gradientn(colours = colorRampPalette(rev(brewer.pal(11,'Spectral')))(32))
3 fill = stat(x)根据计算出来的密度大小着色
library(ggplot2)
library(ggridges)
library(RColorBrewer)
ggplot(lincoln_weather, aes(x = `Mean Temperature [F]`, y = `Month`, fill = stat(x)) + # 指定按照x轴大小填充
geom_density_ridges_gradient(scale =3, rel_min_height = 0.00,size = 0.3) +
scale_fill_gradientn(colours = colorRampPalette(rev(brewer.pal(11,'Spectral')))(32))
4用stat_density_ridfes()画峰峦图,其实它是geom_density_ridges_gradient所要调用的函数,这里可以用stat参数
library(ggplot2)
library(ggridges)
library(RColorBrewer)
ggplot(lincoln_weather, aes(x = `Mean Temperature [F]`, y = `Month`, fill = factor(stat(quantile)))) +
stat_density_ridges(
geom = "density_ridges_gradient",
calc_ecdf = TRUE,
quantiles = c(0.025, 0.975)
) +
scale_fill_manual(
name = "Probability", values = c("#FF0000A0", "#A0A0A0A0", "#0000FFA0"),
labels = c("(0, 0.025]", "(0.025, 0.975]", "(0.975, 1]")
)
5用stat中计算的累积概率值填色
library(ggplot2)
library(ggridges)
library(RColorBrewer)
panel_scaling = T
ggplot(lincoln_weather, aes(x = `Mean Temperature [F]`, y = `Month`, fill = 0.5-abs(0.5-stat(ecdf)))) +
# fill = 0.5-abs(0.5-stat(ecdf)))图形在累积概率达到50%颜色最深,并且两边颜色对称
stat_density_ridges(
geom = "density_ridges_gradient",
calc_ecdf = TRUE
) +
scale_fill_viridis_c(
name = "Probability", direction=-1)
6jittered_point绘制带点的概率分布图
library(ggplot2)
library(ggridges)
library(RColorBrewer)
panel_scaling = T
ggplot(lincoln_weather, aes(x = `Mean Temperature [F]`, y = `Month`, fill = 0.5-abs(0.5-stat(ecdf)))) +
stat_density_ridges(
geom = "density_ridges_gradient",
calc_ecdf = TRUE,
jittered_points = T,
point_size=0.5,
point_shape=19
) +
scale_fill_viridis_c(
name = "Probability", direction=-1)
- JavaScript 教程
- JavaScript 编辑工具
- JavaScript 与HTML
- JavaScript 与Java
- JavaScript 数据结构
- JavaScript 基本数据类型
- JavaScript 特殊数据类型
- JavaScript 运算符
- JavaScript typeof 运算符
- JavaScript 表达式
- JavaScript 类型转换
- JavaScript 基本语法
- JavaScript 注释
- Javascript 基本处理流程
- Javascript 选择结构
- Javascript if 语句
- Javascript if 语句的嵌套
- Javascript switch 语句
- Javascript 循环结构
- Javascript 循环结构实例
- Javascript 跳转语句
- Javascript 控制语句总结
- Javascript 函数介绍
- Javascript 函数的定义
- Javascript 函数调用
- Javascript 几种特殊的函数
- JavaScript 内置函数简介
- Javascript eval() 函数
- Javascript isFinite() 函数
- Javascript isNaN() 函数
- parseInt() 与 parseFloat()
- escape() 与 unescape()
- Javascript 字符串介绍
- Javascript length属性
- javascript 字符串函数
- Javascript 日期对象简介
- Javascript 日期对象用途
- Date 对象属性和方法
- Javascript 数组是什么
- Javascript 创建数组
- Javascript 数组赋值与取值
- Javascript 数组属性和方法
- esp8266+oled 显示时间日期
- esp8266+DHT11温湿传感器 制作web室内温度计
- Linux端口转发的几种常用方法
- kali破解wifi密码
- 面向对象的7种设计原则(7)-开闭原则
- [数据库介绍]一站式表达谱数据分析
- windows下hashcat利用GPU显卡性能破解密码
- TCGAG多组学联合分析数据库
- Docker安装及使用
- CVE-2020-0796漏洞复现(RCE)
- Jenkins持续集成平台安装
- mysql架构备份之M-S-S级联复制
- Docker构建lnmp环境部署typecho
- MANJARO KDE安装配置(已换Arch Linux,此贴可能废弃)
- [数据库推荐]qPCR引物设计与评价