Diels-Alder反应的区域选择性分析
Diels-Alder反应的概况如下:
From Wikipedia
本文以1-甲氧基-1,3-丁二烯与丙烯腈的反应为例,从量子化学角度分析D-A反应的区域选择性问题。反应式和反应物的结构如下:
本文研究的反应
1-甲氧基-1,3-丁二烯(双烯diene)
丙烯腈(亲双烯体dienophile)
首先对两个结构进行结构优化,并进行频率计算以确定是能量极小点。本例中,我们加入pop=full关键词,用来输出分子轨道系数和轨道能量,在后文的分析中会用到。输入文件如下:
Diene:
%chk=R1.chk
%nprocshared=24
%mem=100GB
#p opt freq m062x/6-311g(d,p) pop=full
Title Card Required
0 1
C -1.93811761 1.75328133 0.00040622
H -2.87804883 2.28969158 0.00044963
H -1.02792384 2.34333694 0.00066809
C -1.89644400 0.42042400 0.00004200
H -2.83023807 -0.13837051 -0.00023193
C -0.67471100 -0.36676400 -0.00003700
H -0.74530300 -1.44981000 -0.00030500
C 0.53424400 0.19875000 0.00025700
H 0.66001000 1.28123100 0.00044300
O 1.67158100 -0.53023500 0.00040600
C 2.86762200 0.22557500 -0.00036000
H 3.68809000 -0.48808900 0.00027000
H 2.93537800 0.85275300 -0.89482900
H 2.93547200 0.85441900 0.89293800
Dienophile:
%chk=R2.chk
%nprocshared=24
%mem=100GB
#p opt freq m062x/6-311g(d,p) pop=full
Title Card Required
0 1
C -3.42750607 -2.07709075 0.07206323
H -2.89434232 -3.00479567 0.07206323
H -4.49750607 -2.07709075 0.07206323
C -2.75223176 -0.90211345 0.07206323
H -3.28539551 0.02559147 0.07206323
C -1.21223176 -0.90211345 0.07206323
N -0.06563176 -0.90211345 0.07206323
分析两个分子的HOMO和LUMO能量:
HOMOdiene−LUMOdienophile=−0.235 a.u.
HOMOdienophile−LUMOdiene=−0.366 a.u.
双烯体的HOMO和亲双烯体的LUMO在能量上更为接近,因此应该是这两个前线轨道发生了作用。绘制出这两个轨道,如下图所示:
两个轨道在接近时可能存在以下两种情况,两种情况下轨道的相位均是匹配的:
左图对应邻位产物,右图对应间位产物。以下我们来分析区域选择性。
前线轨道理论指出,对HOMO或LUMO轨道贡献最大的原子通常是反应位点。在一般的有机化学教材上常常描述为双烯体的HOMO和亲双烯体的LUMO中轨道系数较大的原子间成键,可使得HOMO和LUMO达到最有效的重叠,有利于过渡态的稳定。
在Exploring Chemistry with Electronic Structure Methods (3ed) 中,作者使用的方法是直接观察两个轨道在相关原子上的系数。打开两个输出文件,定位至Molecular Orbital Coefficients:处即可看到轨道系数,双烯体的HOMO在1号和8号原子上的基函数的系数如下:
-0.00000 -0.00000
-0.00000 -0.00000
0.00001 -0.00000
-0.00005 0.00002
-0.13707 0.12384
0.00001 -0.00000
0.00002 -0.00001
-0.00008 0.00004
-0.21180 0.20193
-0.00000 0.00007
0.00003 -0.00007
-0.00006 0.00002
-0.23676 0.18557
-0.00001 0.00001
0.00249 0.02629
0.01004 -0.00644
-0.00000 0.00001
-0.00000 -0.00000
1号原子上的系数要比8号原子上的值(绝对值)更大。亲双烯体的LUMO在1号和4号原子上的系数为:
0.00000 0.00000
0.00000 0.00000
0.00000 0.00000
0.00000 0.00000
0.18495 -0.15276
0.00000 0.00000
0.00000 0.00000
0.00000 0.00000
0.26815 -0.22681
0.00000 0.00000
0.00000 0.00000
0.00000 0.00000
0.59092 -0.50111
0.00000 0.00000
0.01825 0.02471
-0.01245 -0.02772
0.00000 0.00000
0.00000 0.00000
1号原子上的系数要比4号原子上的值更大。因此是两个分子的1号原子成键,生成邻位产物。
直接肉眼察看轨道系数并不是一个普适的方法,且原理上也不够严格。更为严格的方法是做轨道成份分析,这方面内容可以参考卢天的论文:
Tian Lu, Feiwu Chen, Acta Chim. Sinica, 69, 2393-2406 (2011)
使用他开发的Multiwfn可以完成相关的计算。
小编还尝试寻找了邻位和间位反应路径的过渡态,结构如下:
小编得到的邻位过渡态的单点能比间位过渡态的单点能低2.67 kcal/mol,感兴趣的读者可以试着找一下这两个过渡态(需要注意立体选择性,D-A反应得到的是内型产物)。找到的同学欢迎留言给出你们的单点能数据。
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